Método para mapear etiquetas de ADN revela nuevos tipos de neuronas
Una nueva técnica clasifica las neuronas mediante la investigación de etiquetas químicas que activan o desactivan genes en el ADN neuronal1. El método representa una nueva forma de mapear la diversidad celular del cerebro. Podría revelar cómo se alteran los patrones de etiquetas químicas llamadas grupos metilo en el autismo.
El grupo metilo se une a la citosina base del ADN. Los patrones de metilación se pueden heredar, pero también pueden cambiar en respuesta a factores ambientales, como la exposición a las hormonas del estrés en el útero o la dieta de la madre. Los patrones de metilación se alteran en los cerebros post mortem de las personas con autismo, informa un estudio.
Los patrones de metilación también varían según el tipo de célula. En un nuevo estudio publicado el 11 de agosto en la revista Science, los investigadores clasificaron las neuronas en tejido cerebral humano y de ratón en función de sus patrones de metilación.
Los investigadores observaron las células en una capa específica de la capa externa del cerebro, conocida como corteza cerebral. Usaron un cóctel químico para aislar los núcleos de las células y colocaron núcleos individuales en cada pocillo de una placa de 384 pocillos. Luego trataron el núcleo con una sustancia química que convierte la citosina, que no tiene grupos metilo, en el uracilo base del ARN. Secuenciaron el ADN para identificar las citosinas restantes, lo que les permitió mapear cada grupo metilo.
Pestaña de reproducción:
Los investigadores aplicaron el método a 3.377 neuronas de ratón y 2.784 neuronas humanas, revelando que 16 neuronas de ratón y 21 humanas tenían patrones distintos de etiquetado de metilo.
El paso de secuenciación permitió a los investigadores determinar qué genes estaban controlados por grupos metilo en cada tipo de neurona. Luego pudieron inferir si un gen se activaba o desactivaba en función de la posición de la etiqueta dentro del gen o en las regiones reguladoras circundantes.
Muchos patrones de metilación correspondían a patrones de expresión génica conocidos en tipos específicos de neuronas. Pero la alineación de los dos grupos metilo apuntó a perfiles de expresión génica únicos, lo que implica dos tipos de neuronas no reconocidos previamente.
Uno de los nuevos tipos impulsó las señales cerebrales en ratones y el otro las suprimió en humanos.
Otras lecturas
Esta historia se publicó originalmente en Spectrum.
